Astaxanthin sintetik danastaxanthin semulajadipada asasnya berbeza; kapasiti, kandungan dan ketulenan antioksidan mereka tidak sama. Mereka berbeza dalam struktur. Oleh itu, terdapat perbezaan dalam keberkesanan dan peranannya.
Ia dihasilkan dalam dua cara: sintesis buatan dan pemerolehan biologi. Sintesis buatan ialah kaedah kimia untuk mendapatkan daripada karotena; secara biologi menjadi semula jadi secara amnya mempunyai tiga sumber biologi: sisa daripada industri pemprosesan produk akuatik, Phaffia rhodozyma, dan mikroalga (Terutamanya Haematococcus Pluvialis).

Ia dihasilkan dalam dua cara: sintesis buatan dan pemerolehan biologi. Sintetik bukan sahaja mahal tetapi juga jauh berbeza daripada alam semula jadi dari segi struktur, fungsi, aplikasi dan keselamatan.
Dari segi struktur:
Disebabkan oleh aktiviti optik kumpulan hidroksil (-oh) pada kedua-dua hujungnya, ia mempunyai tiga isomer: 3s-3's, 3r-3's, 3r-3'r (juga dikenali sebagai levorotatory, racemic, dextrorotatory) Jenis, di mana sintetik adalah campuran 3 jenis struktur (25 peratus kidal, 25 peratus tangan kanan, dan kira-kira 50 peratus rasemik), dengan aktiviti antioksidan yang sedikit, Ia berasal dari ragi. adalah 100 peratus dextrorotatory (3r-3'r) dan mempunyai aktiviti antioksidan separa; dua sumber di atas digunakan terutamanya dalam pewarnaan haiwan dan bahan yang tidak boleh dimakan. Hanya yang berasal dari alga, yang mempunyai struktur levorotatori 100 peratus (3s-3) dan mempunyai aktiviti biologi yang paling kuat.
Sintesis kimia tidak dapat tidak akan memperkenalkan bahan kimia kekotoran, seperti produk sampingan bukan semula jadi yang dijana semasa proses sintesis, yang akan mengurangkan keselamatan bioavailabilitinya. Dengan kebangkitan alam semula jadi, pengurusan bahan kimia yang disintesis telah menjadi lebih dan lebih ketat di negara-negara di seluruh dunia. Contohnya, Pentadbiran Makanan dan Ubat-ubatan (FDA) AS telah melarang yang disintesis secara kimia daripada memasuki pasaran makanan dan makanan tambahan (Suplemen), dan semulajadi telah memperoleh pensijilan keselamatan am (GRAS) dalam FDA. Ia boleh memasuki pasaran makanan dan makanan tambahan secara sah. Pengeluarannya secara amnya cenderung untuk membangunkan sumber biologi alam dan dengan itu menghasilkannya secara besar-besaran.

Sumber astaxanthin yang berbeza mempunyai struktur kimia lain dan pelbagai kapasiti antioksidan. Dan kapasiti antioksidan kuat astaxanthin dicerminkan melalui reka bentuknya yang unik. Astaxanthin yang diekstrak daripada Haematococcus Pluvialis mempunyai 100 peratus struktur levorotatori, dengan kapasiti antioksidan super kuat, dan keberkesanan biologinya juga sangat berkuasa. Astaxanthin yang berasal dari Phaffia mempunyai struktur tangan kanan 100 peratus. Kapasiti antioksidannya adalah yang kedua; ia diekstrak daripada ikan, udang, ketam, dan haiwan lain dan merupakan campuran tiga bentuk. Kuasa antioksidan adalah yang kedua, dan yang terakhir adalah sintesis buatan. Astaxanthin ialah 100 peratus struktur rasemik, tanpa sebarang kapasiti antioksidan, dan tidak mempunyai keberkesanan biologi yang sepatutnya ada pada astaxanthin, jadi ia hanya boleh digunakan sebagai pewarna kimia.
Oleh itu,astaxanthin semulajadilebih unggul daripada astaxanthin sintetik dalam struktur, fungsi fisiologi, kesan aplikasi dan keselamatan.
